Genetischer Kerndatensatz (Metadaten)
Parameter | Datentyp | Ausprägung | Bereich | Bemerkung |
Sequenzierungsart | Enum | Targeted NGS, WES, WGS | ||
Kit-Art | Enum | Agilent ExomV6 | ||
Kit-Hersteller | Enum | Agilent | ||
Sequenziergerät | Enum | Hersteller | ||
Referenzgenome | Object | Klasse: HG19, HG38 | ||
Pipeline | DOI | Version | ||
Tumorzellgehalt (Purity) | Float | 0-1 | berechnet; nicht histologisch | |
Sequenzierung Normalgewebe | Boolean | |||
TMB pro Mb | Float | Tumor samples obersavation Klasse: MSI | unsigned | noch zu klären |
Protokoll-ID | DOI | SOP | ||